MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 5479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014172	CAT	2	6	189	194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506383
2	NC_014172	TAGT	2	8	200	207	25 %	50 %	25 %	0 %	296506383
3	NC_014172	TGA	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506383
4	NC_014172	AAAG	2	8	285	292	75 %	0 %	25 %	0 %	296506383
5	NC_014172	TTA	2	6	313	318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506383
6	NC_014172	GGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506383
7	NC_014172	GA	3	6	336	341	50 %	0 %	50 %	0 %	296506383
8	NC_014172	ATG	2	6	371	376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506383
9	NC_014172	GCAAA	2	10	386	395	60 %	0 %	20 %	20 %	296506383
10	NC_014172	ATG	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506383
11	NC_014172	TA	4	8	431	438	50 %	50 %	0 %	0 %	296506383
12	NC_014172	CTT	2	6	512	517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506383
13	NC_014172	GTG	2	6	539	544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506383
14	NC_014172	A	6	6	555	560	100 %	0 %	0 %	0 %	296506383
15	NC_014172	GAATTA	2	12	622	633	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506383
16	NC_014172	ATTA	2	8	639	646	50 %	50 %	0 %	0 %	296506383
17	NC_014172	ATA	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506383
18	NC_014172	A	6	6	1059	1064	100 %	0 %	0 %	0 %	296506384
19	NC_014172	TATT	2	8	1082	1089	25 %	75 %	0 %	0 %	296506384
20	NC_014172	AGA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506384
21	NC_014172	TGC	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506384
22	NC_014172	GTG	2	6	1215	1220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506384
23	NC_014172	A	7	7	1259	1265	100 %	0 %	0 %	0 %	296506384
24	NC_014172	TAA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506384
25	NC_014172	TCC	2	6	1321	1326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296506384
26	NC_014172	AGC	3	9	1396	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296506384
27	NC_014172	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506384
28	NC_014172	CT	3	6	1438	1443	0 %	50 %	0 %	50 %	296506384
29	NC_014172	AGGA	2	8	1449	1456	50 %	0 %	50 %	0 %	296506384
30	NC_014172	AGA	2	6	1477	1482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506384
31	NC_014172	TCGC	2	8	1496	1503	0 %	25 %	25 %	50 %	296506384
32	NC_014172	TTCTT	2	10	1504	1513	0 %	80 %	0 %	20 %	296506384
33	NC_014172	GGAG	2	8	1525	1532	25 %	0 %	75 %	0 %	296506384
34	NC_014172	TAT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506384
35	NC_014172	ATA	2	6	1560	1565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506384
36	NC_014172	CAT	2	6	1598	1603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506384
37	NC_014172	ATT	2	6	2088	2093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506385
38	NC_014172	A	7	7	2100	2106	100 %	0 %	0 %	0 %	296506385
39	NC_014172	GAA	2	6	2114	2119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506385
40	NC_014172	CT	3	6	2224	2229	0 %	50 %	0 %	50 %	296506385
41	NC_014172	TAA	2	6	2255	2260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506385
42	NC_014172	AT	3	6	2887	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	296506386
43	NC_014172	ATT	2	6	4100	4105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
44	NC_014172	T	7	7	4104	4110	0 %	100 %	0 %	0 %	296506387
45	NC_014172	AATA	2	8	4123	4130	75 %	25 %	0 %	0 %	296506387
46	NC_014172	AT	4	8	4176	4183	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
47	NC_014172	AAT	2	6	4215	4220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
48	NC_014172	TTA	2	6	4234	4239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
49	NC_014172	AAT	2	6	4263	4268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
50	NC_014172	ATC	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
51	NC_014172	TCA	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
52	NC_014172	TTG	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506387
53	NC_014172	TAA	2	6	4599	4604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
54	NC_014172	A	6	6	4632	4637	100 %	0 %	0 %	0 %	296506387
55	NC_014172	TAA	2	6	4655	4660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
56	NC_014172	TTC	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506387
57	NC_014172	TGA	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506387
58	NC_014172	AGAT	2	8	4748	4755	50 %	25 %	25 %	0 %	296506387
59	NC_014172	TGT	2	6	4773	4778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506387
60	NC_014172	AT	3	6	4811	4816	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
61	NC_014172	GAA	2	6	4886	4891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506387
62	NC_014172	TAAT	2	8	4919	4926	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
63	NC_014172	AT	3	6	4931	4936	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
64	NC_014172	TTG	2	6	5043	5048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506387
65	NC_014172	T	6	6	5127	5132	0 %	100 %	0 %	0 %	296506387
66	NC_014172	ACT	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
67	NC_014172	TC	3	6	5236	5241	0 %	50 %	0 %	50 %	296506387
68	NC_014172	TCA	2	6	5302	5307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
69	NC_014172	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
70	NC_014172	ATT	2	6	5370	5375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
71	NC_014172	TCA	2	6	5401	5406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
72	NC_014172	TTA	2	6	5407	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
73	NC_014172	T	6	6	5542	5547	0 %	100 %	0 %	0 %	296506387
74	NC_014172	TCT	2	6	5602	5607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506387
75	NC_014172	TTAC	2	8	5620	5627	25 %	50 %	0 %	25 %	296506387
76	NC_014172	GAA	2	6	5632	5637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506387
77	NC_014172	AT	3	6	5645	5650	50 %	50 %	0 %	0 %	296506387
78	NC_014172	ACT	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
79	NC_014172	CAT	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
80	NC_014172	CTT	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506387
81	NC_014172	ATTT	2	8	5745	5752	25 %	75 %	0 %	0 %	296506387
82	NC_014172	ACT	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
83	NC_014172	GAA	2	6	5787	5792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506387
84	NC_014172	TTA	2	6	5798	5803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
85	NC_014172	AAT	2	6	5819	5824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
86	NC_014172	TGA	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506387
87	NC_014172	AAT	2	6	5893	5898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
88	NC_014172	TCG	2	6	5958	5963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506387
89	NC_014172	CGA	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296506387
90	NC_014172	ATT	2	6	6009	6014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506387
91	NC_014172	TCT	3	9	6034	6042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506387
92	NC_014172	TGG	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506387
93	NC_014172	CAT	2	6	6113	6118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506387
94	NC_014172	GCT	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506387
95	NC_014172	TAAA	2	8	6137	6144	75 %	25 %	0 %	0 %	296506387
96	NC_014172	CTTT	2	8	6289	6296	0 %	75 %	0 %	25 %	296506387
97	NC_014172	TAA	2	6	6318	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506387
98	NC_014172	T	7	7	6353	6359	0 %	100 %	0 %	0 %	296506387
99	NC_014172	GCT	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506388
100	NC_014172	TAAT	2	8	6522	6529	50 %	50 %	0 %	0 %	296506388
101	NC_014172	TCT	2	6	6534	6539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506388
102	NC_014172	AT	3	6	6561	6566	50 %	50 %	0 %	0 %	296506388
103	NC_014172	TAA	2	6	6665	6670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506388
104	NC_014172	T	7	7	6700	6706	0 %	100 %	0 %	0 %	296506388
105	NC_014172	ATC	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506389
106	NC_014172	AAG	2	6	6937	6942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506389
107	NC_014172	T	7	7	6965	6971	0 %	100 %	0 %	0 %	296506389
108	NC_014172	T	7	7	6991	6997	0 %	100 %	0 %	0 %	296506389
109	NC_014172	TTC	2	6	7020	7025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506389
110	NC_014172	ATA	2	6	7063	7068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506389
111	NC_014172	TGG	2	6	7074	7079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506389
112	NC_014172	TAG	2	6	7082	7087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506389
113	NC_014172	CTT	2	6	7088	7093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506389
114	NC_014172	TAAT	2	8	7094	7101	50 %	50 %	0 %	0 %	296506389
115	NC_014172	TCC	2	6	7263	7268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296506389
116	NC_014172	TTC	2	6	7290	7295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506389
117	NC_014172	TAAA	2	8	7398	7405	75 %	25 %	0 %	0 %	296506389
118	NC_014172	TGC	2	6	7431	7436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506389
119	NC_014172	GTG	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506389
120	NC_014172	T	6	6	7523	7528	0 %	100 %	0 %	0 %	296506389
121	NC_014172	ATC	2	6	7539	7544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506389
122	NC_014172	ACC	2	6	7565	7570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506389
123	NC_014172	T	7	7	7583	7589	0 %	100 %	0 %	0 %	296506389
124	NC_014172	AAT	2	6	7649	7654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506389
125	NC_014172	TGT	2	6	7690	7695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506389
126	NC_014172	TAA	2	6	7765	7770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506390
127	NC_014172	ATG	2	6	7804	7809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506390
128	NC_014172	TAA	2	6	7812	7817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506390
129	NC_014172	CCA	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506390
130	NC_014172	ACCAGC	2	12	7957	7968	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296506390
131	NC_014172	ATA	3	9	7976	7984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506390
132	NC_014172	CCA	2	6	8069	8074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506390
133	NC_014172	CTT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506390
134	NC_014172	T	7	7	8148	8154	0 %	100 %	0 %	0 %	296506390
135	NC_014172	AAT	2	6	8191	8196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506390
136	NC_014172	GCTT	2	8	8200	8207	0 %	50 %	25 %	25 %	296506390
137	NC_014172	GCT	2	6	8231	8236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506390
138	NC_014172	CTT	2	6	8277	8282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506390
139	NC_014172	CAC	2	6	8325	8330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506390
140	NC_014172	TAA	2	6	8335	8340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506390
141	NC_014172	AAC	2	6	8395	8400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296506390
142	NC_014172	GTT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506390
143	NC_014172	GTTT	2	8	8524	8531	0 %	75 %	25 %	0 %	296506390
144	NC_014172	TA	3	6	8571	8576	50 %	50 %	0 %	0 %	296506390
145	NC_014172	TCA	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506390
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147	NC_014172	CAG	2	6	8661	8666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296506390
148	NC_014172	GTC	2	6	8683	8688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506390
149	NC_014172	GACA	2	8	8715	8722	50 %	0 %	25 %	25 %	296506390
150	NC_014172	TA	3	6	8727	8732	50 %	50 %	0 %	0 %	296506390
151	NC_014172	CTTTTG	2	12	8751	8762	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	296506390
152	NC_014172	CAG	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296506390
153	NC_014172	AGG	2	6	9020	9025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296506391
154	NC_014172	ATTAAG	2	12	9071	9082	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	296506391
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157	NC_014172	AAT	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506391
158	NC_014172	CCT	2	6	9189	9194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296506391
159	NC_014172	TCA	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506391
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162	NC_014172	TTTA	2	8	9526	9533	25 %	75 %	0 %	0 %	296506392
163	NC_014172	TC	3	6	9625	9630	0 %	50 %	0 %	50 %	296506392
164	NC_014172	T	7	7	9631	9637	0 %	100 %	0 %	0 %	296506392
165	NC_014172	TTC	2	6	9653	9658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506392
166	NC_014172	GGA	2	6	9702	9707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296506392
167	NC_014172	T	7	7	9769	9775	0 %	100 %	0 %	0 %	296506392
168	NC_014172	TC	3	6	9847	9852	0 %	50 %	0 %	50 %	296506392
169	NC_014172	ACA	2	6	9891	9896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296506392
170	NC_014172	TCA	2	6	9945	9950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506392
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177	NC_014172	T	6	6	10583	10588	0 %	100 %	0 %	0 %	296506393
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197	NC_014172	A	7	7	12264	12270	100 %	0 %	0 %	0 %	296506396
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255	NC_014172	TGTC	2	8	15341	15348	0 %	50 %	25 %	25 %	296506399
256	NC_014172	TAA	2	6	15391	15396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506399
257	NC_014172	ATTCC	2	10	15528	15537	20 %	40 %	0 %	40 %	296506399
258	NC_014172	GTAT	2	8	15540	15547	25 %	50 %	25 %	0 %	296506399
259	NC_014172	GGT	2	6	15596	15601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506399
260	NC_014172	AACC	2	8	15608	15615	50 %	0 %	0 %	50 %	296506399
261	NC_014172	TGC	2	6	15644	15649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506399
262	NC_014172	TAA	2	6	15654	15659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506399
263	NC_014172	CTT	2	6	15718	15723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506399
264	NC_014172	GCAG	2	8	15773	15780	25 %	0 %	50 %	25 %	296506399
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